近日,中國科學院國家納米科學中心孫佳姝團隊聯合北京大學藥學院、中國人民解放軍總醫院第五醫學中心、北京大學口腔醫院等,開發了基于凝集素糖類分子識別的熱泳生物傳感新方法,實現了血漿中細胞外囊泡(EV)聚糖圖譜的快速、高靈敏、選擇性分析,并用于三陰性乳腺癌(TNBC)精準診斷、療效監測與預后預測。相關研究成果以Thermophoretic glycan profiling of extracellular vesicles for triple-negative breast cancer management為題,發表在《自然-通訊》(Nature Communications)上。
TNBC是指雌激素受體、孕激素受體、人表皮生長因子受體-2均為陰性的乳腺癌亞型。相比于其他乳腺癌亞型,TNBC惡性程度更高、預后更差。由于缺乏特異性生物標志物,TNBC的臨床診療手段有限。EV攜帶的聚糖在腫瘤演進中發揮重要作用,作為新型腫瘤生物標志物具有潛力。由于體液環境復雜、EV異質性強,以及傳統糖類分析方法復雜繁瑣、靈敏度不足,血液樣本中的EV聚糖圖譜測量面臨挑戰。
該研究發展了基于凝集素糖類分子識別的EV聚糖熱泳分析新方法(EVLET)。研究采用熒光修飾的凝集素特異性標記血漿中EV的表面聚糖,通過振動膜過濾去除未結合的凝集素、可溶性糖蛋白和脂蛋白等干擾物質,進一步利用微流控熱泳富集EV并放大與其偶聯的凝集素熒光信號,實現了EV聚糖的高靈敏、定量檢測,且靈敏度比基于凝集素的ELISA高2個數量級。針對TNBC,研究結合生物信息學與實驗手段篩選出一組特異性凝集素探針,利用EVLET獲取臨床血漿EV聚糖圖譜。基于機器學習算法構建EV聚糖特征,研究實現了TNBC精準診斷,且準確率達到91%。在TNBC療效監測方面,EV聚糖特征對疾病進展或緩解的判斷準確率達到96%,并可作為TNBC患者無進展生存期的獨立預后因素。上述成果為基于EV聚糖圖譜檢測的非侵入性癌癥管理提供了新方法。
研究工作得到國家重點研發計劃、國家自然科學基金、中國科學院穩定支持基礎研究領域青年團隊計劃、中國博士后科學基金以及中國科學院青年創新促進會等的支持。